Wojciech Karłowski


Wojciech Maciej Karłowski, urodzony 10 stycznia 1966 roku, to renomowany polski biolog, który wyróżnia się w dziedzinie biologii molekularnej oraz bioinformatyki. Jako profesor nauk biologicznych, pełni rolę kierownika Zakładu Biologii Obliczeniowej na Wydziale Biologii Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza w Poznaniu.

W swoich badaniach naukowych Wojciech Karłowski koncentruje się na wielu interesujących obszarach, w tym na identyfikacji niekodujących RNA, genomice, analizach wysokoprzepustowych oraz adnotacji funkcjonalnej sekwencji biologicznych. Jego praca odgrywa kluczową rolę w rozwijaniu wiedzy na temat struktury i funkcji biologicznych, co przyczynia się do postępu w naukach biologicznych.

Życiorys naukowy

Wojciech Karłowski, uzdolniony specjalista w dziedzinie biologii molekularnej, swoje wykształcenie zdobył na Wydziale Biologii Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza. Ukończył studia w 1991 roku, a podczas nauki odbył trzymiesięczną praktykę w renomowanym Instytucie Biochemii Uniwersytetu w Kolonii, w laboratorium prof. Lothara Jaenickego, co umożliwiło mu zdobycie cennego doświadczenia.

W latach 1991–1996 skoncentrował się na dalszej edukacji w zakresie genetyki molekularnej roślin, uczestnicząc w studium doktoranckim na tej samej uczelni. Jego badania koncentrowały się na molekularnych mechanizmach, które odgrywają kluczową rolę w procesach symbiotycznego wiązania azotu w roślinach motylkowych. W 1996 roku obronił pracę doktorską pod tytułem ’Geny kodujące brodawkowo-specyficzne białka prolino-bogate w łubinie żółtym’, nad którą czuwał jego promotor, prof. dr hab. Andrzej Legocki.

Po ukończeniu studiów, w latach 1997–2000, odbył staż podoktorski w prestiżowym laboratorium prof. dr Ann Hirsch w Institute of Molecular, Cell and Developmental Biology University of California Los Angeles (UCLA). W tym czasie prowadził badania poświęcone interakcjom symbiotycznym roślin i bakterii, a także analizował nowy gen zidentyfikowany w mutantach lucerny (Medicago sativa), które nie rozwijały się prawidłowo w początkowych fazach symbiozy.

Następnie, od 2001 do 2004 roku, pracował jako naukowiec w Instytucie Bioinformatyki w Monachium, w grupie dr Klausa F.X. Mayera. Skupił się na badaniach z zakresu genomiki obliczeniowej roślin, współpracując z wieloma ośrodkami badawczymi, takimi jak Arizona Genomics Institute, Whitehead Institute czy Rutgers University. Jego najważniejszym projektem w Monachium była bioinformatyczna analiza danych z sekwencjonowania genomu kukurydzy, co pozwoliło na zrozumienie składu oraz historii ewolucji tego ważnego zboża.

W 2004 roku Wojciech Karłowski został pracownikiem Wydziału Biologii UAM. Wkrótce, w 2007 roku, odbył trzy miesiące stażu na Uniwersytecie w Perpignan we Francji, w ramach projektu Marie Curie Host Fellowships for the Transfer of Knowledge. Tu rozpoczął nowy projekt dotyczący analiz bioinformatycznych domen białkowych odpowiedzialnych za procesy wyciszania transkrypcji, współpracując z dr Thierrym Lagrange.

W 2008 roku został zaproszony na Uniwersytet w Perpignan jako profesor wizytujący, gdzie analizował funkcje miRNA w ryżu wraz z prof. Manuelem Echeverria. Rada Wydziału Biologii Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza nadała mu wtedy stopień doktora habilitowanego nauk biologicznych w zakresie biologii. W 2009 roku awansował na stanowisko profesora nadzwyczajnego w Pracowni Bioinformatyki, zakładając własną grupę badawczą, której celem jest prowadzenie projektów z dziedziny genomiki, analizy danych biologicznych oraz badania niekodujących RNA.

W 2014 roku Wojciech Karłowski otrzymał tytuł profesora nauk biologicznych, a także objął kierownictwo Zakładu Biologii Obliczeniowej na Wydziale Biologii UAM. Jego zespół kontynuuje prace nad projektami związanymi z analizą danych biologicznych, wykorzystując metody obliczeniowe do badań procesów biologicznych oraz przeprowadzania skomplikowanych analiz porównawczych, funkcjonalnych i ewolucyjnych.

W swoim dorobku ma liczne publikacje w wiodących międzynarodowych czasopismach naukowych, co potwierdza jego znaczący wkład w rozwój biologii molekularnej i bioinformatyki.

Przypisy

  1. Wojciech M.W.M. Karlowski i inni, Genome-wide computational identification of WG/GW Argonaute-binding proteins in Arabidopsis, „Nucleic Acids Research”, 38 (13), 2010, s. 4231–4245, DOI: 10.1093/nar/gkq162 [dostęp 23.07.2024 r.] (ang.).
  2. Dominique D. Pontier i inni, NERD, a Plant-Specific GW Protein, Defines an Additional RNAi-Dependent Chromatin-Based Pathway in Arabidopsis, „Molecular Cell”, 48 (1), 2012, s. 121–132, DOI: 10.1016/j.molcel.2012.07.027 [dostęp 23.07.2024 r.] (ang.).
  3. S.-I. Lin i inni, Complex Regulation of Two Target Genes Encoding SPX-MFS Proteins by Rice miR827 in Response to Phosphate Starvation, „Plant and Cell Physiology”, 51 (12), 2010, s. 2119–2131, DOI: 10.1093/pcp/pcq170 [dostęp 23.07.2024 r.] (ang.).
  4. Andrzej A. Zielezinski i inni, Benchmarking of alignment-free sequence comparison methods, „Genome Biology”, 20 (1), 2019, DOI: 10.1186/s13059-019-1755-7 [dostęp 23.07.2024 r.] (ang.).
  5. Andrzej A. Zielezinski, Wojciech M.W.M. Karlowski, Integrative data analysis indicates an intrinsic disordered domain character of Argonaute-binding motifs, „Bioinformatics”, 31 (3), 2015, s. 332–339, DOI: 10.1093/bioinformatics/btu666 [dostęp 23.07.2024 r.] (ang.).
  6. Agnieszka A. Thompson i inni, tRex: A Web Portal for Exploration of tRNA-Derived Fragments in Arabidopsis thaliana, „Plant and Cell Physiology”, 59 (1), 2018, e1, DOI: 10.1093/pcp/pcx173 [dostęp 23.07.2024 r.] (ang.).
  7. Wojciech M.W.M. Karlowski i inni, MOsDB: an integrated information resource for rice genomics, „Nucleic Acids Research”, 31 (1), 2003, s. 190–192, DOI: 10.1093/nar/gkg073 [dostęp 23.07.2024 r.] (ang.).
  8. Wojciech M.W.M. Karlowski, The over-expression of an alfalfa RING-H2 gene induces pleiotropic effects on plant growth and development, „Plant Molecular Biology”, 52 (1), 2003, s. 121–133, DOI: 10.1023/A:1023916701669 [dostęp 23.07.2024 r.] (ang.).
  9. Shin-Han S.H. Shiu i inni, Comparative Analysis of the Receptor-Like Kinase Family in Arabidopsis and Rice, „The Plant Cell”, 16 (5), 2004, s. 1220–1234, DOI: 10.1105/tpc.020834 [dostęp 23.07.2024 r.] (ang.).
  10. Kathrin K. Schrick i inni, START lipid/sterol-binding domains are amplified in plants and are predominantly associated with homeodomain transcription factors, „Genome Biology”, 5 (6), 2004, DOI: 10.1186/gb-2004-5-6-r41 [dostęp 23.07.2024 r.] (ang.).
  11. Joachim J. Messing i inni, Sequence composition and genome organization of maize, „Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America”, 101 (40), 2004, s. 14349–14354, DOI: 10.1073/pnas.0406163101 [dostęp 23.07.2024 r.] (ang.).
  12. combio | Research [online], combio.pl [dostęp 19.02.2021 r.]
  13. a b c Prof. dr hab. Wojciech Maciej Karłowski, [w:] baza „Ludzie nauki” portalu Nauka Polska (OPI PIB) [dostęp 20.02.2021 r.]
  14. a b Wolters W. Kluwer, Nadanie tytułu profesora. [online], OpenLEX [dostęp 13.02.2021 r.] (pol.).
  15. Wojtek Karlowski [online], scholar.google.com [dostęp 18.02.2021 r.]
  16. ORCID, Wojciech Karlowski (0000-0002-8086-5404) [online], orcid.org [dostęp 18.02.2021 r.] (ang.).

Oceń: Wojciech Karłowski

Średnia ocena:4.89 Liczba ocen:13